在中國，離婚時子女的撫養(yǎng)權歸屬問題主要依據(jù)《中華人民共和國民法典》及相關司法解釋的規(guī)定，同時也會綜合考慮子女的年齡、父母雙方的撫養(yǎng)能力、子女的意愿等多種因素。以下是北京地區(qū)離婚時兩個孩子撫養(yǎng)權的一般處理方式：

1. 兩周歲以下的子女

原則：兩周歲以下的子女一般由母親直接撫養(yǎng)，除非母親存在以下特殊情況：

患有久治不愈的傳染性疾病或者其他嚴重疾病，子女不宜與其共同生活;

有撫養(yǎng)條件不盡撫養(yǎng)義務，而父親要求子女隨其生活;

因其他原因，子女確不宜隨母親生活。

特殊情況：如果母親有上述不宜撫養(yǎng)的情況，或者雙方協(xié)商一致由父親撫養(yǎng)，法院也會考慮將兩周歲以下的子女判給父親。

2. 兩周歲以上、不滿八周歲的子女

原則：對于兩周歲以上、不滿八周歲的子女，法院會根據(jù)父母雙方的具體情況，按照有利于未成年子女的原則進行判決。主要考慮的因素包括：

父母雙方的經(jīng)濟條件、教育背景、工作穩(wěn)定性等;

子女的生活習慣、教育環(huán)境的連續(xù)性;

父母雙方的撫養(yǎng)意愿和撫養(yǎng)能力;

子女與父母的親密程度、情感依賴程度。

雙方都有撫養(yǎng)意愿：如果父母雙方都希望撫養(yǎng)子女，法院會綜合考慮上述因素，可能將兩個孩子分別判給父母雙方，也可能將兩個孩子判給一方，具體取決于哪種方式更有利于子女的健康成長。

3. 八周歲以上的子女

原則：八周歲以上的子女屬于限制民事行為能力人，法院會尊重其真實意愿。子女的意愿是重要的參考因素，但并不是的決定因素。

綜合判斷：法院在聽取子女意愿的同時，還會結合父母的撫養(yǎng)條件、經(jīng)濟能力、子女的教育和生活需求等因素，綜合判斷哪一方更適合撫養(yǎng)子女。

4. 兩個孩子撫養(yǎng)權的分配方式

一人撫養(yǎng)一個：如果父母雙方的撫養(yǎng)條件相當，且雙方都愿意撫養(yǎng)子女，法院可能會將兩個孩子分別判給父母雙方，每人撫養(yǎng)一個孩子。這種方式可以平衡雙方的撫養(yǎng)權益，但也需要考慮子女之間的情感聯(lián)系和生活穩(wěn)定性。

兩個孩子都判給一方：如果一方的撫養(yǎng)條件明顯優(yōu)于另一方，或者另一方存在不適合撫養(yǎng)子女的情況(如患有嚴重疾病、有不良行為等)，法院可能會將兩個孩子都判給條件較好的一方。例如，如果一方有穩(wěn)定的工作、更好的經(jīng)濟條件和更優(yōu)越的生活環(huán)境，且能夠提供更好的教育和照顧，法院可能會傾向于將兩個孩子都判給這一方。

輪流撫養(yǎng)：在一些特殊情況下，法院可能會判決父母雙方輪流撫養(yǎng)子女。這種方式需要雙方有良好的溝通和配合能力，以確保子女的生活和學習不受影響。例如，雙方可以約定每半年或每年輪流撫養(yǎng)子女。

5. 特殊情況的考慮

子女的特殊需求：如果兩個孩子中有特殊需求的子女(如患有疾病、有特殊教育需求等)，法院會優(yōu)先考慮能夠更好地滿足其特殊需求的一方。

父母的經(jīng)濟和身體狀況：如果一方經(jīng)濟條件較差或身體狀況不佳，可能無法同時撫養(yǎng)兩個孩子，法院會綜合考慮將兩個孩子分別判給父母雙方，或者將兩個孩子判給條件較好的一方。

子女的意愿和情感需求：如果兩個孩子之間情感聯(lián)系緊密，分開撫養(yǎng)可能對他們的心理健康產(chǎn)生不利影響，法院可能會考慮將兩個孩子判給同一方，以保持他們之間的情感聯(lián)系和生活穩(wěn)定性。

6. 協(xié)商優(yōu)先

協(xié)商解決：在離婚過程中，父母雙方可以通過協(xié)商確定子女的撫養(yǎng)權歸屬。協(xié)商一致的，法院一般會尊重雙方的意愿。協(xié)商內容可以包括：

哪一方撫養(yǎng)哪個孩子;

撫養(yǎng)費的支付方式和金額;

探望權的安排等。

協(xié)商不成：如果雙方無法達成一致意見，法院會根據(jù)上述原則和因素進行判決。

7. 探望權

非直接撫養(yǎng)方的探望權：無論子女的撫養(yǎng)權歸屬哪一方，另一方都有權探望子女。探望權的行使方式和時間可以由雙方協(xié)商確定，協(xié)商不成的，由法院判決。

探望權的保障：直接撫養(yǎng)子女的一方有義務協(xié)助另一方行使探望權，不得無故阻撓。如果一方拒絕履行協(xié)助探望義務，另一方可以向法院申請強制執(zhí)行。

8. 撫養(yǎng)費

撫養(yǎng)費的支付：不直接撫養(yǎng)子女的一方應當支付撫養(yǎng)費。撫養(yǎng)費的金額一般根據(jù)子女的實際需要、父母雙方的負擔能力和當?shù)氐膶嶋H生活水平確定。

支付方式：撫養(yǎng)費可以定期支付，也可以一次性支付。具體支付方式可以由雙方協(xié)商確定，協(xié)商不成的，由法院判決。

總結

北京地區(qū)離婚時兩個孩子的撫養(yǎng)權歸屬，主要以有利于子女成長為原則，綜合考慮父母雙方的撫養(yǎng)條件、子女的意愿、子女的年齡和特殊需求等因素。父母雙方應盡量通過協(xié)商解決撫養(yǎng)權問題，協(xié)商不成的，法院會根據(jù)具體情況依法判決。

如果涉及復雜的家庭情況或需要專業(yè)的法律意見，建議咨詢律師，以更好地維護自身和子女的合法權益。